Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssx9Q6XAS3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms