Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt9Q6RHW0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms