Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sohlh1Q6IUP1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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