Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Polr2kQ63871 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms