Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SelplgQ62170 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SelplgQ62170 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms