Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Itga6Q61739 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms