Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Utp20Q5XG71 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Utp20Q5XG71 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms