Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms