Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf224Q3UIW8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms