Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chrna5Q2MKA5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms