Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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