Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rpusd3Q14AI6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rpusd3Q14AI6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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