Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
StumQ0VBF8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
StumQ0VBF8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms