Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn2bQ0KL01 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms