Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf541Q0GGX2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf541Q0GGX2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms