Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms