Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja5Q01231 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms