Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Grin2bQ01097 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Grin2bQ01097 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms