Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Serpina1cQ00896 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Serpina1cQ00896 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms