Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rbp4Q00724 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms