Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp1P97350 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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