Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxd13P70217 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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