Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SbdsP70122 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms