Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms