Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NcanP55066 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NcanP55066 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcanP55066 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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