Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Dbx1P52950 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dbx1P52950 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms