Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LtbP41155 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LtbP41155 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms