Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc3P33622 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms