Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrkcdP28867 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PrkcdP28867 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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