Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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