Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Ggta1P23336 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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