Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P0C1Z5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P0C1Z5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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