Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

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Length 1,307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Setdb1O88974 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Setdb1O88974 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Setdb1O88974 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Setdb1O88974 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Setdb1O88974 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Setdb1O88974 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Setdb1O88974 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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