Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms