Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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