Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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MsmbO08540 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
MsmbO08540 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
MsmbO08540 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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