Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Gm21719J3KMI9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21719J3KMI9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21719J3KMI9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21719J3KMI9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Gm21719J3KMI9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm21719J3KMI9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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