Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Vmn1r34G3XA52 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms