Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3tc1G3X9F6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms