Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3250E9Q1M3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms