Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx60E9PZQ1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms