Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syde2E9PUP1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms