Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc183A2AJB1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc183A2AJB1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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