Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms