Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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