Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms