Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Col4a4Q9QZR9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms