Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gpc1Q9QZF2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms