Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim44Q9QXA7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Trim44Q9QXA7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Trim44Q9QXA7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Trim44Q9QXA7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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