Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mrpl39Q9JKF7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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